Dipeptyd powstaje z połączenia 2 aminokwasów poprzez powiązanie grup funkcyjnych tych aminokwasów ze sobą. Miejsce ich połączenia to wiązanie peptydowe. Pamiętaj, że podczas reakcji powstaje cząsteczka wody (z grupy OH pochodzącej z grupy COOH i atomu H pochodzącego z grupy NH₂), więc przy atomie węgla grupy COOH zostanie tylko jeden atom O, a przy atomie azotu z grupy NH₂ – tylko jeden atom wodoru. Wiązanie peptydowe to wiązanie kowalencyjne, które łączy grupę aminową jednego aminokwasu z grupą karboksylową drugiego aminokwasu. Nie możesz zaznaczyć dowolnego połączenia między atomami C i N w peptydzie, tylko dokładnie to pomiędzy atomem węgla pochodzącym z grupy karboksylowej jednego aminokwasu i atomem azotu pochodzącym z grupy aminowej drugiego aminokwasu, a najlepiej całą grupę atomów O=C–N–H.